تم إبرام اتفاقيتى تعاون بين الجامعة وجامعة الأقصى في مجال استخدام المكتبة المركزية وكذلك المختبرات بحيث سوف تتيح هاتين الاتفاقيتين لطالبات جامعة غزة، بالإضافة إلى استخدام مكتبة ومختبرات الجامعة، الاستفادة من خدمات مكتبة جامعة الأقصى التي تضم مايزيد على 100.000 عنوان وكذلك مختبرات جامعة الأقصى في مختلف المجالات وفي الوقت ذاته فإن نفس الخدمات في جامعة غزة سوف تكون متاحة لطالبات جامعة الأقصى.